sylpheed を 2 系に上げたときから、

(sylpheed:766): LibSylph-WARNING **:
pop.asahi-net.or.jp: SSL certificate verify failed (20: unable to get local issuer certificate)

などと、エラーが出力されるようになった。なお、SSL を有効にして sylpheed を設定している。

調べてみたところ、暗号化は出来ているらしい。